Si tu disposes d'une serre froide, pas trop de problème. Pour le gingko, j'aurais quand même attendu. Il est fragile au niveau des racines et il vaut mieux attendre qu'il soit prêt à démarrer.
Autrement, s'ils sont dehors, il n'est pas nécessaire de protéger tes arbres pour l'instant. Prévoir un voile d'hivernage en cas de retour des gros gels toujours possibles.
Dans le pire des cas, les jeunes feuilles se feront roussir et l'arbre en fera d'autres dans les semaines qui suivront.